以輸出光束的特點分類，光纖激光器可分為連續激光和脈沖激光兩大類別。這兩者有什么技術區別，各自適合于怎樣的應用場景？以下對一般情況的應用進行簡單對比。
顧名思義，連續光纖激光器輸出的激光是連續不斷的，功率維持在一個固定的水平，這個功率即為激光器的額定功率。長時間穩定運行時連續光纖激光器的優勢所在。
而脈沖激光的激光是“時斷時續"的。當然，這個斷續的時間往往很短，通常以毫秒、微秒，甚至納秒、皮秒為單位。相對連續激光，脈沖激光的強弱處于不斷變化中，所以有著“波峰"和“波谷"的概念。
通過脈沖調制，脈沖激光可以快速釋放，在波峰位置達到極大的功率，但由于存在波谷，所以平均功率相對較低。可以想象，如果平均功率一樣，那么脈沖激光的功率峰值可以遠遠大于連續激光，實現比連續激光器更大的能量密度，體現到金屬加工上就是有更大的熔深穿透能力，同時，也適合于不能承受持續性高熱量的熱敏材料，以及一些高反射率材料。
通過兩者的輸出功率特點，我們可以分析得出應用上的區別。
連續光纖激光器通常適合于：
· 大型設備加工，如車船機械，大型鋼板的切割加工，以及其他對熱效應不敏感，但對成本較敏感的加工場合
· 在醫療領域中被用于手術切割和凝固，比如外科手術后止血等· 廣泛應用于光纖通信系統中，用于信號傳輸和放大，具有高穩定性和較低的相位噪聲
· 在科學研究領域中用于光譜分析、原子物理實驗和激光雷達等應用，可提供高功率和高光束質量的激光輸出
而脈沖光纖激光器通常適合于：
· 不能承受太強熱效應、或者質地較脆材料的精密加工場合，如對電子芯片、陶瓷玻璃、醫用生物零件的加工
· 材料反射率較高，容易因反射損壞激光頭本身。比如對銅、鋁材料的加工
· 對易受損基材的外部進行表面處理或清洗
· 需求短時間的高功率，深穿透力的加工場合，如厚板切割，金屬材料打孔等，
· 需要應用脈沖作為信號特征的場合。比如光纖通信和光纖傳感器等等
· 在生物醫學領域中用于眼科手術、皮膚治療和組織切割等，具備較高的光束質量和調制性能
· 3D打印中，實現較高精度和復雜結構的金屬零件制造
· 先進激光等
